次氯酸鈉分解反應的關鍵步驟是原子氧的放出，而光照或加熱有利于原子氧的生成。研究表明，當溫度低于25℃時分解緩慢，溫度高于30℃時分解速度明顯加快。光照20h，次氯酸鈉的有效氯會降解90%。另外，次氯酸鈉分解生成的O2，Cl2都是氣體物質，長時間密閉保存會給包裝容器帶來危險。因此，次氯酸鈉的包裝容器都要留出放氣孔，以防止發生安全事故。因而，次氯酸鈉溶液應盡量在低溫、避光環境下儲存，可有效地降低分解速度。
和次氯酸鈉相比，鑒于氯氣的危害更為直接和嚴重，中華人民共和國《危險化學品安全管理條例》和《危化品運輸管理條例》對氯氣的使用、管理以及運輸的要求更為苛刻，而這極大的增加了使用氯氣消毒的間接成本。
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